海外コミュニティのredditで、コントロールモードで取得できたチームワークバッジの処置について開発が回答しております。
ユーザーからのコントロールモードでチームワークバッジを取得できたバグについての質問に対し、
開発者のRobotHavGunz氏は「バッジを取得できるのはバグが原因だが、コントロールでバッジを取得したプレイヤーからバッジが削除されることはありません。」と回答しました。
上記のように回答していることから、今回のバグで入手できたチームワークバッジが削除されることは無いようです。
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オリジナルサイトで読む ： Apex Legendsまとめ速報 – えぺタイムズ
【Apex】コントロールモードで取得したチームワークバッジの処置について開発が回答